开展淡水渔业资源调查与评估，鱼类种质资源收集、鉴定、保护及渔业资源变动规律等基础研究工作；开展水产养殖动物育种，土著经济鱼类开发、保护，渔业资源恢复，水生珍稀濒危物种驯养、繁殖和救护等技术研究；开展水生动物生理、生态、增养殖等技术研究；开展饲料营养、消化吸收、代谢调控规律和机制等研究，研发优质、环保、高效能配合饲料；开展水生动物病害检验检测及疫病防控，淡水渔业环境、水产品质量安全监测和检验检测，渔业水域污染调查评估；开展淡水渔业新品种新技术试验、示范推广、技术培训、技术开发与咨询服务等工作。