| 序号 | 项目及品种名称 | 规格/型号 | 物资质量技术标准或 服务内容及标准要求 |
计量 单位 |
采购 数量 |
预算单价（万元） | 预算 总金额 （万元） |
| 项目名称 | **.* | ||||||
| * | 多组学检测 | 转录组学 | *.样本类型：白膜层细胞 *. rna提取要求：（*）rna总量要求：每个样本rna提取量不低于***ng且浓度不低于**ng/μl；（*）rna完整性要求：rna的rin≥* *.建库方式要求：普通转录组文库 ●*.测序平台：illumina xplus *.上机模式：pe***测序 *.数据量及质控要求：（*）数据量要求：每个样本有效数据量≥* g raw data；（*）下机数据质量要求，q**＞**%，q**＞**%，gc分布正常。 *.生信分析要求 *.*数据质控：对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量reads的处理、数据产出统计及测序数据的成分和质量评估。 *.*参考基因组比对分析。 *.*基因表达水平分析：样本间基因表达水平的相关性分析、主成分分析、基因差异表达分析。 *.*差异表达基因中转录因子鉴定。 *.*差异基因富集分析：go、kegg富集分析。 *.*差异表达基因的蛋白质互作网络分析。 *.* gsea分析。 *.周期要求：**个自然日内交付结果 |
例 | *** | *.**** | **.** |
| * | 宏基因组学 | *.样本类型：粪便 *.样本提取质控要求：（*）dna提取量要求：单个样本提取dna总量不低于**ng且浓度不低于*ng/μl *.建库方式要求：dna小片段文库 ●*.测序平台：illumina xplus *.上机模式：pe***测序 *.数据量及质量要求：（*）数据量要求：每个样本有效数据量≥* g raw data；（*）数据质量要求，q**＞**%，q**＞**%，gc分布正常 *.生信分析要求 *.*数据质控：对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量reads的处理、数据产出统计及测序数据的成分和质量评估。 *.* metagenome组装。 *.*基因预测及丰度分析：gene catalogue统计、core-pan分析、基因数目差异分析（异箱图、venn图/花瓣图）、相关性分析。 *.*物种相对丰度分析：物种相对丰度概况，注释基因数目及相对丰度聚类分析，基于物种丰度的降维分析、anosim分析、聚类分析、metagenomeseq分析、lefse分析、random forest分析。 *.*功能注释及分析：kegg、eggnog、cazy、phi、vfdb、注释基因数目分析、功能相对丰度概况、功能相对丰度聚类分析、基于功能丰度的降维分析、anosim分析、聚类分析、代谢通路比较分析、代谢通路注释基因数目及差异ec分析、metagenomeseq分析、lefse分析。 *.*抗性基因注释及分析：抗性基因丰度概况，抗性基因类型的分布及丰度聚类分析，基于抗性基因丰度的anosim分析、组间抗性基因数目差异分析、metagenomeseq分析、lefse分析、抗性基因与物种归属关系。 *.周期要求：**个自然日内交付结果 |
例 | *** | *.**** | *.** | |
| * | 非靶向代谢组学 | *．样本类型：血浆，尿液，唾液 ●*.色谱仪器平台满足：扫描速率最高** hz，分辨率在m/z ***处为***,***，质量范围：**至****m/z。动态范围＞****:*；质量准确度:内部：*.检测时间要求：使用内标大于*个，正负离子模式，单个样本检测时长**-** min。 *.生信分析要求 *.*数据质控：qc相关性分析、总样品pca分析； *.*代谢物定性定量分析，代谢物分类分析； *.*代谢物通路及分类注释：hmdb注释，lipid注释，lipidmaps等； *.*差异代谢物筛选：pca分析、pls-da分析、火山图分析、火柴杆图分析、venn图、箱线图、小提琴图、聚类分析热图、k-means分析、相关性热图、z-score分析等； *.*差异代谢物富集分析：kegg分类图、kegg气泡图、kegg通路图、kegg调控网络图分析等 *.*gsea分析及差异代谢物roc曲线分析（生物标志物筛选）； *.*代谢组学与宏基因组学关联分析。 *.分析软件及数据库要求 *.*分析软件要求：使用compound discover进行数据分析； *.*分析数据库要求：利用不少于两个代谢化合物数据库（包含mzcloud、mzvault等）进行搜库鉴定及注释。 *.周期要求：**个自然日内交付结果 |
例 | *** | *.*** | **.** | |
| * | dia定量蛋白质组学 | *.样本类型：血浆 *.蛋白提取质控要求：每个样本提取获总量不低于**μg，且浓度不低于*μg/μl。 ●*.质谱仪器平台满足：动态范围单张orbitrap质谱谱图内>;*,***，质量检测范围在**-*,***道尔顿，质量准确度：外标法●*.液相色谱仪满足：最大压力**** bar (**,*** psi)，流速范围* nl/min - *** μl/min，增幅为* nl，色谱柱温度范围高于环境温度*°c至**°c。 ●*.采用top** abundant protein depletion中型离心柱方法去除血液中的高峰度蛋白。 *.仪器运行时间要求：单个样品上机时间**-** min。 *.有设备连续**个自然日以上的稳定测试，且拥有血液大队列样本(n＞***)经验和批次效应处理的方案。 *.生信分析要求 *.*数据质控：dia质控报告、鉴定总览统计表格； *.*蛋白功能注释：功能注释结果venn图、低丰度蛋白浓度注释分析、组织特异性分泌注释分析、亚细胞定位分析、结构域注释分析、go功能注释分析、cog功能注释分析、kegg功能注释分析、转录因子分析等； *.*定量分析：定量统计结果、pca分析、重复性分析； *.*差异蛋白筛选和分析：火山图、差异蛋白浓度注释分析、聚类分析、富集分析（go、kegg、结构域、亚细胞定位）、组织特异性分泌注释分析、gsea分析、互作分析等； *.* dia质控：肽段长度分布、内标irt检出分析、unique肽段数分布； *.*蛋白组与代谢组、转录组关联分析。 *.蛋白鉴定数量要求：合格样品鉴定的蛋白数量不低于****个。 **.周期要求：**个自然日内交付结果 |
例 | *** | *.** | **.* |
