多组学检测采购公告
（****-JQXWCD-F****）
****年**月**日，我部组织了该项目的第三次采购活动，因只有*家供应商现场递交投标文件流标。现我部就以下项目进行国内第四次竞争性谈判采购，采购资金已全部落实，欢迎符合条件的供应商参加。
一、项目名称：多组学检测
二、项目编号：****-JQXWCD-F****
三、项目概况：
序号 |
项目及品种名称 |
规格/型号 |
物资质量技术标准或
服务内容及标准要求 |
计量
单位 |
采购
数量 |
预算单价（万元） |
预算
总金额
（万元） |
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项目名称 |
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**.* |
* |
多组学检测 |
转录组学 |
*. 样本类型：白膜层细胞
*. RNA提取要求：（*）RNA总量要求：每个样本RNA提取量不低于***ng且浓度不低于**ng/µl；（*）RNA完整性要求：RNA的RIN≥*
*. 建库方式要求：普通转录组文库
●*. 测序平台：Illumina Xplus
*.上机模式：PE***测序
*. 数据量及质控要求：（*）数据量要求：每个样本有效数据量≥* G raw data；（*）下机数据质量要求，Q**＞**%，Q**＞**%，GC分布正常。
*. 生信分析要求
*.*数据质控：对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量reads 的处理、数据产出统计及测序数据的成分和质量评估。
*.*参考基因组比对分析。
*.*基因表达水平分析：样本间基因表达水平的相关性分析、主成分分析、基因差异表达分析。
*.*差异表达基因中转录因子鉴定。
*.*差异基因富集分析：GO、KEGG富集分析。
*.*差异表达基因的蛋白质互作网络分析。
*.* GSEA分析。
*. 周期要求：**个自然日内交付结果 |
例 |
*** |
*.**** |
**.** |
* |
宏基因组学 |
*. 样本类型：粪便
*. 样本提取质控要求：（*）DNA提取量要求：单个样本提取DNA总量不低于**ng且浓度不低于*ng/µl
*. 建库方式要求：DNA小片段文库
●*. 测序平台：Illumina Xplus
*.上机模式：PE***测序
*. 数据量及质量要求：（*）数据量要求：每个样本有效数据量≥* G raw data；（*）数据质量要求，Q**＞**%，Q**＞**%，GC分布正常
*. 生信分析要求
*.*数据质控：对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量reads 的处理、数据产出统计及测序数据的成分和质量评估。
*.* Metagenome组装。
*.*基因预测及丰度分析：gene catalogue统计、core-pan 分析、基因数目差异分析（异箱图、Venn图/花瓣图）、相关性分析。
*.*物种相对丰度分析：物种相对丰度概况，注释基因数目及相对丰度聚类分析，基于物种丰度的降维分析、Anosim分析、聚类分析、MetaGenomeSeq分析、LEfSe 分析、Random Forest分析。
*.*功能注释及分析：KEGG、eggNOG、CAZy、PHI、VFDB、注释基因数目分析、功能相对丰度概况、功能相对丰度聚类分析、基于功能丰度的降维分析、Anosim分析、聚类分析、代谢通路比较分析、代谢通路注释基因数目及差异EC分析、MetaGenomeSeq分析、LEfSe 分析。
*.*抗性基因注释及分析：抗性基因丰度概况，抗性基因类型的分布及丰度聚类分析，基于抗性基因丰度的Anosim分析、组间抗性基因数目差异分析、MetaGenomeSeq分析、Lefse分析、抗性基因与物种归属关系。
*. 周期要求：**个自然日内交付结果 |
例 |
*** |
*.**** |
*.** |
* |
非靶向代谢组学 |
*．样本类型：血浆，尿液，唾液
●*. 色谱仪器平台满足：扫描速率最高** Hz，分辨率在m/z ***处为***,***，质量范围：**至****m/z。动态范围＞****:*；质量准确度:内部：，外部：。灵敏度：全扫描MS：柱上*** fg丁螺环酮S/N ***:*，SIM：柱上** fg丁螺环酮可获得***:*或更佳的S/N。
*. 检测时间要求：使用内标大于*个，正负离子模式，单个样本检测时长**-** min。
*. 生信分析要求
*.*数据质控：QC相关性分析、总样品PCA分析；
*.*代谢物定性定量分析，代谢物分类分析；
*.*代谢物通路及分类注释：HMDB注释，LIPID注释，LIPIDMaps等；
*.*差异代谢物筛选：PCA分析、PLS-DA分析、火山图分析、火柴杆图分析、Venn图、箱线图、小提琴图、聚类分析热图、K-Means分析、相关性热图、Z-score分析等；
*.*差异代谢物富集分析：KEGG分类图、KEGG气泡图、KEGG通路图、KEGG调控网络图分析等
*.*GSEA分析及差异代谢物ROC曲线分析（生物标志物筛选）；
*.*代谢组学与宏基因组学关联分析。
*.分析软件及数据库要求
*.*分析软件要求：使用Compound Discover 进行数据分析；
*.*分析数据库要求：利用不少于两个代谢化合物数据库（包含mzCloud、mzVault等）进行搜库鉴定及注释。
*. 周期要求：**个自然日内交付结果 |
例 |
*** |
*.*** |
**.** |
* |
DIA定量蛋白质组学 |
*. 样本类型：血浆
*. 蛋白提取质控要求：每个样本提取获总量不低于** μg，且浓度不低于* μg/μl。
●*.质谱仪器平台满足：动态范围单张Orbitrap 质谱谱图内>*,***，质量检测范围在**-*,***道尔顿，质量准确度：外标法内标法，质量分辨率m/z *** 时高达***,***，扫描速率*** Hz。
●*.液相色谱仪满足：最大压力**** bar (**,*** psi)，流速范围* nL/min - *** µL/min，增幅为* nL，色谱柱温度范围高于环境温度*°C 至**°C。
●*. 采用Top** Abundant Protein Depletion 中型离心柱方法去除血液中的高峰度蛋白。
*.仪器运行时间要求：单个样品上机时间**-** min。
*.有设备连续**个自然日以上的稳定测试，且拥有血液大队列样本(n＞***)经验和批次效应处理的方案。
*. 生信分析要求
*.*数据质控：DIA质控报告、鉴定总览统计表格；
*.*蛋白功能注释：功能注释结果Venn图、低丰度蛋白浓度注释分析、组织特异性分泌注释分析、亚细胞定位分析、结构域注释分析、GO功能注释分析、COG功能注释分析、KEGG功能注释分析、转录因子分析等；
*.*定量分析：定量统计结果、PCA分析、重复性分析；
*.*差异蛋白筛选和分析：火山图、差异蛋白浓度注释分析、聚类分析、富集分析（GO、KEGG、结构域、亚细胞定位）、组织特异性分泌注释分析、GSEA分析、互作分析等；
*.* DIA质控：肽段长度分布、内标iRT检出分析、unique肽段数分布；
*.*蛋白组与代谢组、转录组关联分析。
*. 蛋白鉴定数量要求：合格样品鉴定的蛋白数量不低于****个。
**.周期要求：**个自然日内交付结果 |
例 |
*** |
*.** |
**.* |
四、报价供应商资格条件
（一）符合《中华人民共和国政府采购法》第二十二条资格条件：
*.具有独立承担民事责任的能力；
*.具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度；
*.具有履行合同所必需的设备和专业技术能力；
*.有依法缴纳税收和社会保障资金的良好记录；
*.参加政府采购活动前*年内，在经营活动中没有重大违法记录；
*.法律、行政法规规定的其他条件。
（二）国有企业；事业单位；军队单位；成立*年以上的非外资独资企业或控股企业。
（三）单位负责人为同一人或存在直接控股或管理关系的不同供应商，不得同时参加同一包的采购活动。生产场经营地址或注册登记地址为同一地址的不同生产型企业，股东和管理人员（法定代表人、董事或监事）之间存在近亲属或相互占股等关联关系的不同非国有销售型企业，也不得同时参加同一包的采购活动。近亲属指夫妻、直系血亲、三代以内旁系血亲或近姻亲关系。
（四）未被中国政府采购网（www.ccgp.gov.cn）列入政府采购严重违法失信行为记录名单，未在军队采购网（www.plap.mil.cn）军队采购暂停名单处罚范围内或军队采购失信名单禁入处罚期和处罚范围内，以及未被“信用中国”（www.creditchina.gov.cn）列入严重失信主体名单或国家企业信用信息公示系统（www.gsxt.gov.cn）列入严重违法失信名单（处罚期内）。
（五）供应商管理信息系统进行注册
参加本单位采购活动的供应商，必须事先通过军队采购网（互联网：plap.mil.cn）供应商管理信息系统进行注册，实行凡采必入。依托电子招投标系统实施的电子化项目，供应商必须完成注册，方可报名、获取采购文件。线下组织的非电子化项目，供应商可先行获取采购文件，但必须在提交投标（报价）文件截止时间前完成注册，未完成的不得参加采购活动（应急采购项目除外）。提供完成注册相关证明截图。
五、谈判文件申领时间、地点、方式
（一）申领时间：****年**月**日至**月**日，每日上午*:**至**:**，下午**:**至**:**（申领时间不少于*个工作日）。
（二）申领地点：网上发售。
（三）申领谈判文件时需提供以下材料：
*.营业执照或事业单位法人证书复印件加盖公章（军队单位不需要提供）；
*.法定代表人资格证明书原件；
*.法定代表人授权书原件，授权代表身份证和授权代表在报价前*个月内（不含报价当月）连续*个月由报价供应商缴纳社保证明材料的复印件；
*.非外资独资企业或控股企业的书面声明（事业单位、军队单位不需要提供）；
*.报价供应商主要股东或出资人信息；
*.未被列入本公告第四条第（四）项明确的违法失信名单的承诺书；
*.报名登记表。
（四）申领方式
网上发送。报价供应商采取发送电子邮件方式提交报名材料，邮件主题：项目名称+项目编号+公司名称；邮件内容：列明公司名称、法定代表人或授权代表人姓名及联系方式；邮件附件：需采用A*纸幅面，将报名材料加盖企业鲜章，按顺序制作成*个PDF格式文件，文件名称与主题一致，复印件扫描无效。报名材料审核通过后，采购机构联系人向供应商邮箱发送谈判文件电子版；审核未通过的，采购机构联系人以邮件形式回复审核情况，供应商可在谈判文件申领时间内重新提交材料。采购机构或代理机构邮箱：
*********@qq.com。
（五）免收标书费。
六、报价开始和截止时间及地点、方式
（一）报价开始时间：****年**月**日*时**分。
（二）报价截止时间：****年**月**日*时**分。
（三）报价地点：四川省成都市（详见竞争性谈判文件）。
（四）报价方式：由报价供应商法定代表人或授权代表现场提交报价文件，不接受邮寄等其他方式。
七、谈判时间、地点
（一）谈判时间：****年**月**日*时**分（应当与报价截止时间保持一致）。
（二）谈判地点：四川省成都市（详见竞争性谈判文件）。
八、本采购项目相关信息在《军队采购网》（www.plap.mil.cn）和《医院门户网站》(****************.mil.cn)上发布。
九、采购机构联系方式
联系人：杨助理
邮箱：*********@qq.com,
十、监督部门联系方式
项目监督人：医院纪委
